Équipe Biogéographie et Diversité des Interactions du Sol "BioDIS" - iEES Paris

L’objectif de l’équipe BioDIS est de proposer une analyse des interactions des sols dans leur contexte environnemental, dans le but de prédire le fonctionnement biologique et l’évolution des sols.

Notre stratégie de recherche propose d’étudier les interactions biologiques en prenant en compte les contraintes abiotiques (qui ne sont pas liées à l’activité d’êtres vivants) qui régulent ou modulent ces interactions, selon trois axes de recherche :

  • une analyse fonctionnelle des interactions, selon qu’elles soient de nature physique, chimique et/ou biochimique et les répercussions sur les fonctions émergentes du sol ;

  • une analyse spatiale, nommée biogéographie des interactions, dans laquelle nous tenterons de mettre en évidence l’impact de la structuration spatiale sur l’organisation des interactions à différentes échelles (du paysage à l’habitat microbien) ;

  • une analyse temporelle, nommée évolution des interactions, dans laquelle nous analyserons l’impact de la sélection naturelle, des flux de gènes et de la dérive génétique sur les interactions.

Graphique sol
Légende : L’objet d’étude de l’équipe BioDIS concerne les interactions intra et inter groupes fonctionnels du sol (plante, vers de terre, microorganismes). Ces interactions peuvent être de différentes natures (axe « analyse fonctionnelle »), et sont déterminées par la position des organismes et la structuration du sol (axe « analyse spatiale ») ainsi que par les contraintes évolutives à l’origine de leur dynamique (axe « analyse temporelle »).
Seule une intégration de ces différents aspects permet la compréhension et la prédiction du fonctionnement des sols.

Le sol est un système complexe et constitue un élément fondamental des écosystèmes terrestres. Il participe à la réalisation d’un grand nombre de services écosystémiques, tels que la production de nourriture, l’épuration des eaux, le recyclage des déchets organiques ou le stockage de carbone.

Une particularité du sol est sa très forte structuration spatiale conduisant à la coexistence d’une multitude d’habitats aux propriétés variées. L’organisation spatiale des pores et des éléments solides du sol conduit à une distribution de l’oxygène, des solutés ou de l’eau extrêmement complexe et dont les gradients peuvent être très forts sur une distance d’à peine quelques micromètres.
Ces environnements sont également très dynamiques puisque leurs propriétés physico-chimiques peuvent changer rapidement, sous l’effet de l’activité microbienne, des racines des plantes et des vers de terre. Ceci a pour conséquence une modification rapide des contraintes sélectives auxquelles sont soumis les organismes du sol, en particulier due à la capacité de nombre d’entre eux à créer leur propre niche écologique.

La notion d’habitat en interaction avec l’activité biologique apparaît donc centrale pour mieux comprendre le fonctionnement biologique du sol. Plus que tout autre domaine de l’écologie, l’écologie des sols doit intégrer les interactions biotiques-abiotiques et les interactions entre micro- et macroorganismes.

Publications de l'équipe

Ne concerne que les publications de 2017 à aujourd’hui. Pour voir toutes les publications dirigez-vous vers la page Publications.

RéférenceLiensJournalEquipes et départements impliqués
Justine J.-L., Marie A. D., Gastineau R., Fourcade Y.*, Winsor L. (2022) The invasive land flatworm Obama nungara in La Réunion, a French island in the Indian Ocean, the first report of the species for Africa. Zootaxa, 5154: 469 476
10.11646/zootaxa.5154.4.4
🔗 pdf
Zootaxa
BioDISDCFE
​Pongmala, K.~, A. Pierret*, P. Oliva, A. Pando*, V. Davong`, S. Rattanavong`, N. Silvera*, M. Luangraj`, L. Boithias, K. Xayyathip` L. Menjot, M. Macouin, E. Rochelle-Newall*, H. Robain*, A. Vongvixay`, A. J. H. Simpson, D. A. B. Dance and O. Ribolzi (2022). “Distribution of Burkholderia pseudomallei within a 300-cm deep soil profile: implications for environmental sampling.” Scientific Reports 12(1): 8674.
10.1038/s41598-022-12795-0
Scientific Reports
CoMiCDCFE ; F2ZCSols_ZC ; BioDISDCFE
Changey F, Nunan N.*, Herrmann A.H., Lerch T.Z.* (2022) Catching change in microbial diversity indicators under different soil organic matter managements: Higher taxonomic resolution, better discrimination? 
10.1016/j.ecolind.2022.108897
🔗 HAL
🔗 pdf
Ecological Indicators
BioDISDCFE
Fourcade, Y.*, & Vercauteren, M.° (2022). Predicted changes in the functional structure of earthworm assemblages in France driven by climate change. Diversity and Distributions 28: 1050-1066. 
10.1111/ddi.13505
🔗 HAL
🔗 pdf
Diversity and Distributions
BioDISDCFE
Fourcade, Y.,* Winsor, L., & Justine, J.-L. (2022). Hammerhead worms everywhere ? Modelling the invasion of bipaliin flatworms in a changing climate. Diversity and Distributions, 28: 844-858. 
10.1111/ddi.13489
🔗 HAL
🔗 pdf
Diversity and Distributions
BioDISDCFE
Sonntag, S.°, & Fourcade, Y.* (2022). Where will species on the move go? Insights from climate connectivity modelling across European terrestrial habitats. Journal for Nature Conservation, 66, 12613910.1016/j.jnc.2022.126139
Journal for Nature Conservation
BioDISDCFE
Alexandre Coche, Tristan Babey, Alain Rapaport, Laure Vieuble Gonod, Patricia Garnier, Naoise Nunan*, Jean-Raynald de Dreuzy (2022) Competition within low-density bacterial populations as an unexpected factor regulating carbon decomposition in bulk soil. Soil Biology and Biochemistry,164,108423, 
10.1016/j.soilbio.2021.108423
🔗 HAL
🔗 pdf
Soil Biology & Biochemistry
BioDISDCFE
Fourcade Y.* (2021) Fine-tuning niche models matters in invasion ecology. A lesson from the land planarian Obama nungara. Ecological Modelling, 457: 109686, 10.1016/j.ecolmodel.2021.109686
10.1016/j.ecolmodel.2021.109686Ecological ModellingBioDISDCFE
​Iry Andrianjara~, Marianne Bordenave-Jacquemin*, Virginie Roy*, Cécile Cabassa*, Pierre Federici*, David Carmignac*, Yoan Marcangeli*, Germinal Rouhan, Mathilde Renard, François Nold, Jean-Christophe Lata*, Patricia Genet*, Séverine Planchais* (2021) Urban tree management: diversity of Tilia genus in streets and parks of Paris based on morphological and genetic characteristics, Urban Forestry & Urban Greening

10.1016/j.ufug.2021.127382
🔗 HAL
URBAN FORESTRY & URBAN GREENINGAPCEIPE ;BioDISDCFE ; EERIDCFE ; EMSDCFE ; ESEAEEcoEvo
Zhang, N., Nunan, N.*, Hirsch, P.R., Sun B., Zhou J., Liang Y. (2021) Theory of microbial coexistence in promoting soil–plant ecosystem health. Biology & Fertility of Soils, (sous presse)​
10.1007/s00374-021-01586-wBiology & Fertility of SoilsBioDISDCFE


Mbé, B., Monga, O., Pot, V., Otten, W., Hecht, F., Raynaud, X.*, Nunan, N.*, Chenu, C., Baveye, P.C., & Garnier, P. 2021. Scenario modelling of carbon mineralization in3D soil architecture at the microscale: Toward an accessibility coefficient of organic matter for bacteria. European Journal of Soil Science.
10.1111/ejss.13144European Journal of Soil ScienceBioDISDCFE ; EERIDCFE ; EMSDCFE
​Hugoni M, Nunan N*, Thioulouse J, Dubost A, Abrouk D, Martins JMF, Goffner D, Prigent-Combaret C, Grundmann G (2021) Small-Scale Variability in Bacterial Community Structure in Different Soil Types. Microbial Ecology (sous presse)10.1007/s00248-020-01660-0
🔗 HAL
🔗 pdf
Microbial EcologyBioDISDCFE
​Nakhle, P.; Boithias, L.; Pando-Bahuon, A*.; Thammahacksa,C.`; Gallion, N.; Sounyafong, P`.; Silvera, N*.; Latsachack, K.`; Soulileuth,B.`; Rochelle-Newall, E.J*.; Marcangeli, Y;* Pierret, A*; Ribolzi, O*. Decay Rate of Escherichia coli in a
Mountainous Tropical Headwater Wetland. Water 2021, 13, 2068., https://doi.org/10.3390/w13152068
10.3390/w13152068WaterBioDISDCFE ; CoMiCDCFE ; EMSDCFE ; FESTSols_ZC
Fourcade, Y*, Astrom S, Öckinger E (2021) Decline of parasitic and habitat-specialist species drives taxonomic, phylogenetic and functional homogenization of sub-alpine bumblebee communities. Oecologia, 196: 905-917, 10.1007/s00442-021-04970-310.1007/s00442-021-04970-3OecologiaBioDISDCFE
​Kleber, M., Bourg, I.C., Coward, E.K., Hansel, C.M., Myneni, S.C.B., Nunan, N*., 2021. Dynamic interactions at the mineral–organic matter interface. Nature Reviews Earth & Environment. 10.1038/s43017-021-00162-y
🔗 HAL
🔗 pdf
Nature Reviews Earth & EnvironmentBioDISDCFE
Fourcade Y.*, WallisDeVries M.F., Kuussaari M., Van Swaay C.A.M., Heliölä J., Öckinger E. (2021) Habitat amount and distribution modify community dynamics under climate change. Ecology Letters, 24, 950-95710.1111/ele.13691
🔗 HAL
🔗 pdf
Ecology LettersBioDISDCFE
Laurie Boithias, Yves Auda, Stéphane Audry, Jean-Pierre Bricquet, Alounsavath Chanhphengxay`, Vincent Chaplot,  Anneke de Rouw*, Thierry Henry des Tureaux*, Sylvain Huon*, Jean-Louis Janeau*, Keooudone Latsachack`, Yann Le Troquer*, Guillaume Lestrelin, Jean-Luc Maeght, Pierre Marchand, Pierre Moreau, Andrew Noble, Anne Pando-Bahuon*, Kongkeo Phachomphon`, Khambai Phanthavong`, Alain Pierret*, Olivier Ribolzi, Jean Riotte, Henri Robain*, Emma Rochelle-Newall*, Saysongkham Sayavong`, Oloth Sengtaheuanghoung`, Norbert Silvera*, Nivong Sipaseuth`, Bounsamay Soulileuth`, Xaysatith Souliyavongsa`, Phapvilay Sounyaphong`, Sengkeo Tasaketh`, Chanthamousone Thammahacksa`, Jean-Pierre Thiebaux, Christian Valentin*, Olga Vigiak, Marion Viguier^, Khampaseuth Xayyathip`.(2021) The Multiscale TROPIcal CatchmentS critical zone observatory M-TROPICS dataset II: Land use, hydrology and sediment production monitoring in Houay Pano, northern Lao PDR. Hydrological Processes. 2021;35:e14126.10.1002/hyp.14126
🔗 HAL
Hydrological ProcessesBioDISDCFE ; CoMiCDCFE ; FESTSols_ZC ; F2ZCSols_ZC
Maggia M.-E., Decaëns T., Lapied E., Dupont L.*, Roy V.*, Schimann H., Orivel J., Murienne J., Baraloto C., Cottenie K., Steinke D. At each site its diversity: DNA barcoding reveals remarkable earthworm diversity in neotropical rainforests of French Guiana. Applied Soil Ecology, 164 : 10393210.1016/j.apsoil.2021.103932Applied Soil EcologyBioDISDCFE
​Kheir M., Lerch T.Z.*, Borsali A.H., Roche P., Ziarelli F., Zouidi M., Farnet Da Silva A.M. (2021) Litter microbial responses to climate change: how do inland or coastal context and litter type matter across the Mediterranean? Ecological Indicators 125: 10750510.1016/j.ecolind.2021.107505Ecological IndicatorsBioDISDCFE
​Nakhle P., Ribolzi O., Boithias L., Rattanavong S., Auda Y., Sayavong S., Zimmermann R., Soulileuth B., Pando A*., Thammahacksa C., Rochelle-Newall E.J.*, Santini W., Martinez J-M., Gratiot N., Pierret A*.(2021) “Effects of hydrological regime and land use on in-stream Escherichia coli concentration in the Mekong basin, Lao PDR”. Scientific Reports, 11:3460.10.1038/s41598-021-82891-0
🔗 HAL
🔗 pdf
Scientific ReportsBioDISDCFE ; CoMiCDCFE
​Sisouvanh P’, Trelo-Ges V’., Isarangkool Na Ayutthaya S’., Pierret A.*, Nunan N*., Silvera N.*, Xayyathip K’., Hartmann C*. (2021) Can organic amendments improve soil physical characteristics and increase maize performances in contrasting soil water regimes? Agriculture, 11, 132.10.3390/agriculture11020132AgricultureCoMiCDCFE ; BioDISDCFE ; F2ZCSols_ZC
Nakhle P., Ribolzi O., Boithias L., Rattanavong S.’, Auda Y., Sayavong S.’, Zimmermann R.E., Soulileuth B.’, Pando A*., Tammahacksa C’., Rochelle-Newall E.*, Santinin W., Martinez J.-M., Gratiot N., Pierret A.* (2021) Effects of hydrological regime and land use on in-stream Escherichia coli concentration in the Mekong basin, Lao PDR, Scientific Reports – Nature 11:3460 10.1038/s41598-021-82891-0​Scientific ReportsCoMiCDCFE ; BioDISDCFE
​Shi A, Chakrawal A, Manzoni S, Fischer BMC, Nunan N*, Herrmann AH (2021) Substrate spatial heterogeneity reduces soil microbial activity. Soil Biology & Biochemistry, 152, 10806810.1016/j.soilbio.2020.108068
🔗 HAL
🔗 pdf
Soil Biology and BiochemistryBioDISDCFE
Pham T.`°, Rumpel C.*, Capowiez Y., Jouquet P.*, Pelosi C., Pando A.*, Aroui Boukdiba H.*, Bottinelli N.*. (2021). Mid-infraned spectroscopy of earthworm bodies to investigate their species belonging and their relationship with the soil they inhabit. Applied Soil Ecology 162.10.1016/j.apsoil.2021.103894
🔗 HAL
Applied Soil EcologyBioDISDCFE ; FESTSols_ZC
Guttières R~, Nunan N*, Raynaud X*, Lacroix G*, Barot S*, Barré P, Girardin C, Guenet B, Lata J-C*, Abbadie L*. 2021. Temperature and soil management effects on carbon fluxes and priming effect intensity. Soil Biology and Biochemistry 153: 10810310.1016/j.soilbio.2020.108103
🔗 HAL
🔗 pdf
Soil Biology and BiochemistryEMSDCFE ; BioDISDCFE
Alhajeri B., Fourcade Y.*, Upham N. S., Alhaddad H. (2020) A global test of Allen’s rule in Rodents. Global Ecology & Biogeography​​, 29: 2248-2260
10.1111/geb.13198Global Ecology & Biogeography​BioDISDCFE
Foti L~, Barot S*, Gignoux J*, Grimaldi M*, Lata J-C*, Lerch T.Z.*, Nold F, Nunan N*, Raynaud X*, Abbadie L*, Dubs F* 2020. Topsoil characteristics of forests and lawns along an urban-rural gradient in the Paris region. Soil Use and Management: 1-13 10.1111/sum.12640
🔗 HAL
Soil Use and ManagementEMSDCFE ; BioDISDCFE ; FESTSols_ZC
​Frerejacques M., Rousselle C., Gauthier L., Cottet-Emard S., Derobert L., Roynette A., Lerch T.Z.*, Changey F. (2020) Human skin bacterial community response to probiotic (Lactobacillus reuteri DSM 17938) introduction. Microorganisms 8, 122310.3390/microorganisms8081223
🔗 HAL
MicroorganismsBioDISDCFE
Widhalm T., Fourcade Y.*, Frank T., Öckinger, E. (2020) Population dynamics of the butterfly Pyrgus armoricanus after translocation beyond its northern range margin. Insect Conservation and Diversity, 13: 617-629
10.1111/icad.12430Insect Conservation and DiversityBioDISDCFE
​Borsali A.H., Lerch T.Z.*, Besbes R., Gros R., Laffont-Schwob I., Boudenne J.L., Ziarelli F., Pando A.*, Farnet Da Silva A.M. (2021)  Coastal environments shape chemical and microbial properties of forest litters in circum Mediterranean region assessment. European Journal of Soil 72: 1010-102510.1111/ejss.13023
🔗 HAL
🔗 pdf
European Journal of Soil ScienceBioDISDCFE
Changey F^., Blaud A., Pando A*., Herrmann A., Lerch T.Z.*. (2020). Monitoring soil microbial communities using molecular tools: DNA extraction methods may offset long-term management effects. European Journal of Soil Science 72: 1026-104110.1111/ejss.13026
🔗 HAL
European Journal of Soil ScienceBioDISDCFE
​Lehmann, J., Hansel, C.M., Kaiser, C., Kleber, M., Maher, K., Manzoni, S., Nunan, N., Reichstein, M., Schimel, J.P., Torn, M.S., Wieder, W.R., Kögel-Knabner, I., 2020. Persistence of soil organic carbon caused by functional complexity. Nat. Geosci. 13, 529–534.10.1038/s41561-020-0612-3
🔗 HAL
🔗 pdf
Nature GeoscienceBioDISDCFE
Fourcade Y.*, Richardson D.S., Secondi J. (2020) No evidence for a loss of genetic diversity despite a strong decline in size of a European population of the corncrake Crex crex. Bird Conservation International, 30: 260-266


10.1017/S0959270919000327Bird Conservation InternationalBioDISDCFE
Célini L.*, Roy V.*, Delabie J., Frechault S.*, Mora P.* (2020). Présence de Solenopsis globularia (F. Smith, 1858) et Cardiocondyla emeryi Forel, 1881 (Formicidae : Myrmicinae) dans l’île de Saint Barthélemy aux Antilles Françaises. Bulletin de la Société Entomologique de France, 125 (2) : 145 162.​10.32475/bsef_2061Bulletin de la Société Entomologique de FranceBioDISDCFE ; ESEAEEcoEvo
Nunan N, Schmidt H, Raynaud X. 2020. The ecology of heterogeneity: soil bacterial communities and C dynamics. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 375: 20190249.10.1098/rstb.2019.0249
🔗 HAL
🔗 pdf
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological SciencesEMSDCFE ; BioDISDCFE
Pruvost C.~
, Mathieu J.*, Nunan N.,* Gigon A.*, Pando A.*, Lerch T.Z.*, Blouin M. 2020.Tree growth and macrofauna colonization in Technosols constructed from recycled urban wastes. Ecological Engineering, 153, 105886​
10.1016/j.ecoleng.2020.105886
🔗 HAL
🔗 pdf
Ecological EngineeringBioDISDCFE ; EERIDCFE
​Taheri S.~, Decaëns T., Cunha L., Brown G.G., Da Silva E., Bartz M.L.C., Baretta D., Dupont L.* (2020) Genetic evidence of multiple introductions and mixed reproductive strategy in the peregrine earthworm Pontoscolex corethrurus. Biological Invasions, 22 : 2545-255710.1007/s10530-020-02270-0
🔗 HAL
🔗 pdf
Biological InvasionsBioDISDCFE
Chakrawal, A., Herrmann, A.M., Koestel, J., Jarsjö, J., Nunan, N., Kätterer, T., Manzoni, S., 2020. Dynamic upscaling of decomposition kinetics for carbon cycling models. Geoscientific Model Development 13, 1399–1429.10.5194/gmd-13-1399-2020
🔗 HAL
🔗 pdf
Geoscientific Model DevelopmentBioDISDCFE
Baudrin G.°, Roy V.*, Gigon A.*, Dupont L.* (2020) Bar-HRM for identification of cryptic earthworm species. Pedobiologia – Journal of Soil Ecology, 80: 15063410.1016/j.pedobi.2020.150634Journal of Soil EcologyBioDISDCFE
Audusseau H.^, Vandenbulcke F., Dume C.°, Deschins V.°, Pauwels M., Gigon A.*, Bagard M.*, Dupont L.* (2020) Impacts of metallic trace elements on an earthworm community in an urban wasteland: Emphasis on the bioaccumulation and genetic characteristics in Lumbricus castaneus. Science of the Total Environnement, 718 : 13725910.1016/j.scitotenv.2020.137259
🔗 HAL
Science of the Total EnvironmentBioDISDCFE ; APCEIPE
​Brunel C., Gros R., Lerch T.Z.*, Farnet Da Silva A.M. (2020) Changes in soil organic matter and microbial communities after fine and coarse residues inputs from Mediterranean tree species. Applied Soil Ecology 149: 10351610.1016/j.apsoil.2020.103516
🔗 HAL
🔗 pdf
Applied Soil EcologyBioDISDCFE
Paradelo R., Lerch T.Z.*, Houot S., Dignac M.-F.* (2019) Composting modifies the patterns of incorporation of OC and N from plant residues into soil aggregates. Geoderma, 353: 415-422. 10.1016/j.geoderma.2019.07.025
🔗 HAL
GeodermaCoMiCDCFE ; BioDISDCFE
Lerch T.Z.*, Dignac M.-F.*, Thevenot M., Mguerchi C.°, Houot S. (2019) Chemical changes during composting of plant residues reduce their mineralisation in soil and cancel the priming effect. Soil Biology and Biochemistry, 136: 107525. 10.1016/j.soilbio.2019.107525
🔗 HAL
Soil Biology and BiochemistryCoMiCDCFE ; BioDISDCFE
Changey F., Meglouli H., Fontaine J., Magnin-Robert M., Lerch T.Z.*, Lounès-Hadj Sahraoui A. (2019) Initial microbial status modulates mycorrhizal inoculation effect on rhizosphere microbial communities. Mycorrhiza 29(5): 475-487.10.1007/s00572-019-00914-1
🔗 HAL
MycorrhizaBioDISDCFE
​Clement, C~., Pierret A*., Maeght JL., Hartmann C*., Xayyathip K’., Soulileuth B’., Sounyafong P.’, Latsachack K’., Thammahacksa C’., Sengtaheuanghoung O’.  (2019) Linking tree‐rooting pro les to leaf phenology: a first attempt on Tectona Grandis Linn F. Trees 33, pages 1491–1504 (2019).10.1007/s00468-019-01876-9
🔗 HAL
TreesCoMiCDCFE ; BioDISDCFE
Alhajeri B.H., Fourcade Y.* (2019) High correlation between species-level environmental data estimates extracted from IUCN expert range maps and from GBIF occurrence data. Journal of Biogeography, 46: 1329-1341

10.1111/jbi.13619Journal of BiogeographyBioDISDCFE
Dupont L.*, Pauwels M., Dume C.°, Deschins V.°, Audusseau H.^, Gigon A.*, Dubs F., Vandenbulcke F. (2019) Genetic variation of the epigeic earthworm Lumbricus castaneus populations in urban soils of the Paris region (France) revealed using eight newly developed microsatellite markers. Applied Soil Ecology, 135 : 33-3710.1016/j.apsoil.2018.11.004
🔗 HAL
Applied Soil EcologyBioDISDCFE
James S.W., Bartz M.L.C., Stanton D.W.G., Conrado A.C.,Dupont L.*,Taheri S.~, Da Silva E., Cunha L., Brown G.G. (2019) A neotype for Pontoscolex corethrurus (Müller, 1857) (Clitellata). Zootaxa, 4545 (1) : 124-13210.11646/zootaxa.4545.1.7
🔗 HAL
ZootaxaBioDISDCFE
Schmidt, H., Nunan, N.*, Höck, A., Eickhorst, T., Kaiser, C., Woebken, D., Raynaud, X.*, 2018. Recognizing Patterns: Spatial Analysis of Observed Microbial Colonization on Root Surfaces. Frontiers in Environmental Science 6.10.3389/fenvs.2018.00061
🔗 HAL
🔗 pdf
Frontiers in Environmental ScienceBioDISDCFE ; EMSDCFE
Fourcade Y.* ,Åström S., Öckinger E. (2019) Climate and land-cover change alter bumblebee species richness and community composition in subalpine areas. Biodiversity and Conservation, 28: 639–653


10.1007/s10531-018-1680-1Biodiversity and ConservationBioDISDCFE
Fourcade Y.*, BesnardA.G., Beslot E., Hennique S., Mourgaud G., Berdin G., Secondi J (2018) Habitat selection in a dynamic seasonal environment: Vegetation composition drives the choice of the breeding habitat for the community of passerines in floodplain grasslands. Biological Conservation, 228: 301-309

10.1016/j.biocon.2018.11.007Biological ConservationBioDISDCFE
Baveye, P.C., Otten, W., Kravchenko, A., Balseiro-Romero, M., Beckers, É., Chalhoub, M., Darnault, C., Eickhorst, T., Garnier, P., Hapca, S., Kiranyaz, S., Monga, O., Mueller, C.W., Nunan, N.*, Pot, V., Schlüter, S., Schmidt, H., Vogel, H.-J., 2018. Emergent Properties of Microbial Activity in Heterogeneous Soil Microenvironments: Different Research Approaches Are Slowly Converging, Yet Major Challenges Remain. Frontiers in Microbiology 9​10.3389/fmicb.2018.01929
🔗 HAL
🔗 pdf
Frontiers in MicrobiologyBioDISDCFE
Van Groenigen, J.W., Agnelli, A., Bai, J., Capowiez, Y., Cayuela, M., Kögel-Knabner, I., Laird, D., McBratney, A., Morgan, C., Nater, E.A., Nunan, N., Said-Pullicino, D., Vepraskas, M., 2018. Citation stacking in soil science articles: our response to the open letter by concerned early-career soil scientists. Geoderma 328, 119–120.10.1016/j.geoderma.2018.03.023GeodermaBioDISDCFE
Obiakara M.C., Fourcade Y.* (2018) Climatic niche and potential distribution of Tithonia diversifolia (Hemsl.) A. Gray in Africa. PlosOne, 13: e0202421


10.1371/journal.pone.0202421PLoS ONEBioDISDCFE
Sengtaheuanghoung O., Ribolzi O., Rochelle-Newall E. J.*, Boithias L., Evrard O., Henri-des-Tureaux T.*, Huon S.*, Janeau J.-L*., Latsachack K*., Lefèvre I., Mouche E., Robain H.*, de Rouw A.*, Xayyathip K.*, Silvera N.*, Sisouvanh P~., Soulileuth B.*, Sounyafong P*., Thammahacksa C*., Viguier M., Lacombe G., Valentin C. & Pierret. A.*, Interactions between land use, fluxes of water and sediments, and the spread of bacterial contaminants in the uplands of northern Lao PDR. In: Nations, F. A. O. (ed) Proceedings of the Global Symposium on Soil Pollution 2018, Rome, Italy, 2018. FAO, p 976.FAO EditionsCoMiCDCFE ; BioDISDCFE ; F2ZCSols_ZC ; FESTSols_ZC
​Changey F.^, Bagard M.*, Souleymane M.°, Lerch T.Z.* (2018) Cascading effects of elevated ozone on wheat rhizosphere microbial communities depend on temperature and cultivar sensitivity. Environmental Pollution 242: 113-12510.1016/j.envpol.2018.06.073
🔗 HAL
Environmental PollutionBioDISDCFE ; EcoPhySIPE
Porco D., Chang C.-H.,Dupont L.*, James S., Richard B. , Decaëns T. (2018) A reference library of DNA barcodes for the earthworms from Upper Normandy: Biodiversity assessment, new records, potential cases of cryptic diversity and ongoing speciation. Applied Soil Ecology, 124 : 362-37110.1016/j.apsoil.2017.11.001
🔗 HAL
Applied Soil EcologyBioDISDCFE
Taheri S.~, James S.W., Roy V.*, Decaëns T., Williams B.W., Anderson F., Rougerie R., Chang C.-H., Brown G. G., Cunha L., Stanton D. W. G., Silva E.D., Chen J.-H., Lemmon A., Bartz M., Baretta D., Barois I., Lapied E., Coulis M., Dupont L.* (2018) Complex taxonomy of the ‘brush tail’ peregrine earthworm Pontoscolex corethrurus. Molecular Phylogenetics and Evolution, 124, 60-70.
10.1016/j.ympev.2018.02.021
🔗 HAL
Molecular Phylogenetics and EvolutionBioDISDCFE
Mathieu J.*, Caro G.~ & Dupont L.* (2018) Methods for studying earthworm dispersal. Applied Soil Ecology, 123 : 339-34410.1016/j.apsoil.2017.09.006
🔗 HAL
🔗 pdf
Applied Soil EcologyEERIDCFE ; BioDISDCFE
Fougeyrollas R.~, Dolejšová K., Křivánek J., Sillam-Dussès D.*, Roisin Y., Hanus R., Roy V. *(2018) Dispersal and mating strategies in two neotropical soil-feeding termites, Embiratermes neotenicus and Silvestritermes minutus (Termitidae, Syntermitinae). Insectes Sociaux, 65, 251-262.10.1007/s00040-018-0606-y
🔗 HAL
Insectes SociauxBioDISDCFE ; ESEAEEcoEvo
Milcu A.; Puga-Freitas R*.; Ellison A.M., Blouin M., Scheu S., Girin T., Freschet G.T., Rose L., Scherer-Lorenzen M., Barot S*., Lata J-C*., Cesarz S., Eisenhauer N., Gigon A*.,Weigelt A., Hansart A., Greiner A., Pando A*., Gessler A.,  Grignani C., Assandri D., Gleixner G., Le Galliard J-F*., Urban-Mead K., Laura Zavattaro L., MüllerM.E.H., LangeM., Martin Lukac M., Bonkowski M., Mannerheim N., Buchmann N.,  Butenschoen O., Rotter P., Seyhun R., Devidal S., Kayler Z., and J Roy J.(2018).Genotypic variability enhances the reproducibility of an ecological study.  Nature Ecology and Evolution. 2, p279–28710.1038/s41559-017-0434-x
🔗 HAL
Nature Ecology and EvolutionBioDISDCFE ; EMSDCFE ; EcoPhySIPE ; VPAEcoEvo
Taheri S.~, Pelosi C.,Dupont L.* (2018) Harmful or useful ? A case study of the exotic peregrine earthworm morphospeciesPontoscolex corethrurus. Soil Biology and Biochemistry, 116: 277-28910.1016/j.soilbio.2017.10.030
🔗 HAL
🔗 pdf
Soil Biology and BiochemistryBioDISDCFE
​Agapit, C.~, Gigon, A.*, Puga-Freitas, R.*, Zeller, B., Blouin, M. Plant-earthworm interactions: influence of age and proportion of casts in the soil on plant growth, morphology and nitrogen uptake. Plant Soil 424, 49–61 (2018).10.1007/s11104-017-3544-y
🔗 HAL
Plant SoilEcoPhySIPE ; BioDISDCFE
Fourcade Y.*, Besnard A.G., Secondi J. (2018) Paintings predict the distribution of species, or the challenge of selecting environmental predictors and evaluation statistics. Global Ecology and Biogeography, 27: 245-256



10.1111/geb.12684
🔗 HAL
Global Ecology & Biogeography​BioDISDCFE
Jouquet P*., Pando A*.; Aroui H*.; Harit A.`^; Capowiez Y.; Bottinelli N*.2017. Evidence from Mid-Infrared Spectroscopy (MIRS) that the biological fingerprints of Odontotermes obesus termite colonies change according to their geographical location and age. (2017). Insectes Sociaux 65:77–8410.1007/s00040-017-0589-0
🔗 HAL
Insectes SociauxBioDISDCFE ; FESTSols_ZC
Deeb M.~, Desjardins T.*, Podwojewski P.*, Pando A.*, Blouin M., Lerch T.Z.* (2017) Interactive effects of compost, plants and earthworms on aggregation in constructed Technosols. Geoderma 305: 305–31310.1016/j.geoderma.2017.06.014
🔗 HAL
GeodermaBioDISDCFE ; FESTSols_ZC
Nunan, N.*, 2017. The microbial habitat in soil: Scale, heterogeneity and functional consequences. Journal of Plant Nutrition and Soil Science 180, 425–429.​10.1002/jpln.201700184
🔗 HAL
🔗 pdf
Journal of Plant Nutrition and Soil ScienceBioDISDCFE
Nunan, N.*, Leloup, J.*, Ruamps, L.S.~, Pouteau, V., Chenu, C., 2017. Effects of habitat constraints on soil microbial community function. Scientific Reports 7.10.1038/s41598-017-04485-z
🔗 HAL
🔗 pdf
Scientific ReportsBioDISDCFE ; EMSDCFE
Foti L.~, Dubs F.^, Gignoux J.*, Lata J.C.*, Lerch T. Z*, Mathieu J.*, Nold F., Nunan N.*,Raynaud X.*, Abbadie L.*, Barot S.* (2017) Trace metal concentrations along a gradient of urban pressure in forest and lawn soils of the Paris region (France). Science of the Total Environment, 598: 938-94810.1016/j.scitotenv.2017.04.111
🔗 HAL
Science of the Total EnvironmentEMSDCFE ; BioDISDCFE ; EERIDCFE
Fourcade Y.*, Ranius T., Öckinger E. (2017) Temperature drives abundance fluctuations, but spatial dynamics is constrained by landscape configuration: implications for climate-driven range shift in a butterfly. Journal of Animal Ecology, 86: 1339-1351



10.1111/1365-2656.12740Journal of Animal EcologyBioDISDCFE
Leloup, J.*, Baude, M.~, Nunan, N.*, Meriguet, J., Dajoz, I.*, Le Roux, X., Raynaud, X.* (2018) Unravelling the effects of plant species diversity and aboveground litter input on soil bacterial communities. Geoderma 317, 1–7.10.1016/j.geoderma.2017.12.018
🔗 HAL
GeodermaEMSDCFE ; BioDISDCFE ; EERIDCFE
Vergnes A.^, Blouin M., Muratet A, Lerch T.Z.*, Mendez-Millan M., Rouelle-Castrec M., Dubs F.^ (2017) Initial conditions during Technosol implementation shape earthworms and ants diversity. Landscape and Urban Planning 159 : 32-4110.1016/j.landurbplan.2016.10.002
🔗 HAL
Landscape and Urban PlanningBioDISDCFE
Lerch T.Z.*, Chenu C., Dignac M.-F.*, Barriuso E., Mariotti A. (2017) Biofilm vs planktonic lifestyle: consequences on pesticide 2,4-D biodegradation by Cupriavidus necator JMP134.  Frontiers in Microbiology 8 : 9010.3389/fmicb.2017.00904
🔗 HAL
🔗 pdf
Frontiers in MicrobiologyBioDISDCFE ; CoMiCDCFE
​Fougeyrollas R.~, Křivánek J., Roy V.*, Dolejšová K., Frechault S.*, Roisin Y., Hanus R., Sillam-Dussès D. (2017). Asexual queen succession mediates an accelerated colony life cycle in the termite Silvestritermes minutus. Molecular Ecology, 26, 3295–330810.1111/mec.14095
🔗 HAL
Molecular EcologyBioDISDCFE ; ESEAEEcoEvo

🔗 Voir l’ensemble des publications de l’institut

Membres de l'équipe

Nom PrénomCorpsEmployeurDépartement et ÉquipeAdresseTéléphoneMél
DUPONT LiseMCUniv. Paris Est CréteilÉquipe BioDIS du Département DCFEUniv. Paris Est Créteil
bâtiment P – 4e étage – bureau : 418
(+33) 01 45 17 16 64lise.dupont@u-pec.fr
EL MEKDAD FatimaDoctoranteSorbonne UniversitéÉquipe BioDIS du Département DCFECampus Pierre et Marie Curie – Paris 5e
Tour 44-45 – 2e étage – bureau : 218
(+33) 01 44 27 47 30fatima.el_mekdad@sorbonne-universite.fr
FOURCADE YoanMCUniv. Paris Est CréteilÉquipe BioDIS du Département DCFEUniv. Paris Est Créteil
bâtiment P – 4e étage – bureau : 422
(+33) 01 45 17 14 69yoan.fourcade@u-pec.fr
GERGONNE DamienDoctorantCNRSÉquipe BioDIS du Département DCFEUniv. Paris Est Créteil
bâtiment P – 2e étage – bureau : 211
gergonne.damien@gmail.com
GIGON AgnesIEUniv. Paris Est CréteilÉquipe BioDIS du Département DCFEUniv. Paris Est Créteil
bâtiment P – 4e étage – bureau : 422
(+33) 01 45 17 14 69gigon@u-pec.fr
GUEYE Mamadou
CDD AI
IRD
Équipe BioDIS du Département DCFE
IRD Bondy
Batîment AB – 1er étage – bureau : 1
(+33) 01 48 02 55 31
mamadou.gueye@ird.fr
HARTMANN Christian
CR
IRD
Équipe BioDIS du Département DCFE
IRD Bondy
bâtiment A – RDC – bureau : 114
(+33) 01 48 02 59 71
christian.hartmann@ird.fr
LERCH ThomasMCUniv. Paris Est CréteilÉquipe BioDIS du Département DCFEIRD Bondy
bâtiment A – RDC – bureau : 1
(+33) 01 48 02 79 33thomas.lerch@u-pec.fr
MIKAJLO Irina
Post-doctorant
IRD
Équipe BioDIS du Département DCFE
IRD Bondy
bâtiment A – RDC – bureau : A1
(+33) 01 48 02 55 90
irina.mikajlo@ird.fr
NUNAN NaoiseCRCNRSÉquipe BioDIS du Département DCFECampus Pierre et Marie Curie – Paris 5e
Tour 44-45 – 2e étage – bureau : 212
(+33) 01 44 27 41 06 naoise.nunan@upmc.fr
PANDO AnneIRIRDÉquipe BioDIS du Département DCFEExpatriée à NAFRI/DALaM VIENTIANE LAOS
Bat A – RDC – bureau : 01
(+33) 01 48 02 55 90anne.pando@ird.fr
PRINTANIER Jean-François
CDD IE
IRD
Équipe BioDIS du Département DCFE
IRD Bondy
bâtiment A – RDC – bureau : A114
(+33) 01 48 02 79 41
jean-francois.printanier@ird.fr
ROCHA ARAUJO Jose HilarioDoctorantEst-EnsembleÉquipe BioDIS du Département DCFEIRD Bondy
bâtiment B – Sous-sol étage – bureau : 8
(+33) 01 80 25 698jose.araujo@ird.fr
ROY VirginieMCUniv. Paris Est CréteilÉquipe BioDIS du Département DCFEUniv. Paris Est Créteil
bâtiment P – 4e étage – bureau : P4-420
(+33) 01 45 17 16 14roy@u-pec.fr

🔗 Voir l’organigramme

🔗 Voir l’annuaire