ROY Virginie
Enseignant-chercheur
Maître de conférences Université Paris-Est Créteil
Département Diversité des Communautés et Fonctionnement des Écosystèmes “DCFE”
Équipe Biogéographie et Diversité des Interactions du Sol “BioDIS”
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Recherche
Activités
J’effectue ma recherche dans le Département Diversité des Communautés et
Fonctionnement des Écosystèmes (DCFE), dans l’équipe Biogéographie et
Diversité des Interactions du Sol (BioDIS). Mes thématiques de recherche
sont la délimitation et l’identification des espèces, les systèmes de
reproduction et la dispersion de la macrofaune du sol, en particulier
dans les écosystèmes tropicaux. Mes modèles sont les termites humivores,
les vers de terre, les fourmis, et plus récemment les plathelminthes
terrestres invasifs et les bruches. J’utilise des outils moléculaires
(barcoding et métabarcoding ADN, Bar-HRM, séquençage multigénique,
génotypage microsatellites) et mes approches sont la phylogéographie, la
génétique/génomique des populations et la taxonomie intégrative.
I carry out my research within the Community Diversity and Ecosystem Functioning Department (DCFE), in the Biogeography and Diversity of Interactions in Soil (BioDIS) team. My research topics are species delineation and identification, reproductive systems and dispersal of soil macrofauna, particularly in tropical ecosystems. My models are soil-feeding termites, earthworms, and more recently, invasive terrestrial flatworms. I use molecular tools (DNA barcoding and metabarcoding, Bar-HRM, multigene sequencing, microsatellite genotyping) and my approaches are phylogeography, population genetics and integrative taxonomy.
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Projets
- 2022-2025
Financement : ANR, Appel à projets générique – AAPG 2021
Titre : Impact of the PLATyhelminthe Obama nungara invasion on earthWORM communities in France
Responsable scientifique : Lise Dupont, iEES-Paris
Fonction : responsable du Work-Package 2 Earthworms’ community disturbance, under O. nungara invasion, responsable de l’analyse métagénomique.
- 2019-2020
Financement : CNRS PEPS Ecologie des mobilités : espèces invasives, dispersion, migration, recomposition dans des mondes en mutation – ECOMOB 2019
Titre : Les plathelminthes terrestres invasifs : prédation sur les vers de terre et défense chimique
Fonction : coordinatrice du projet, co-responsable de l’action 2 : caractérisation du type de proies et détermination des espèces de vers de terre consommées par O. nungara par métabarcoding du contenu digestif
- 2019-2021
Financement : Appel d’offre Soutien à la structuration et au développement de la recherche, Agence Universitaire de la Francophonie
Titre : Lutte contre l’insécurité alimentaire par la gestion intégrée des insectes ravageurs de pois (Bruchus pisorum) et de haricots (Acanthoscelides obtectus) en plantation et en stockage.
Responsable scientifique : Pr. Attibayeba, Université Marien Ngouabi, Brazzaville
Fonction : Responsable de la caractérisation moléculaire des Bruchus et Acanthoscelides (Lot 1 : Structuration des biotypes de B. pisorum et Acanthoscelides obtectus dans l’espace Congo-Gabon-Cameroun et détermination des cycles phénologiques des variétés de haricots et de pois dans les zones de production).
- 2022-2025
Function: responsible for Work-Package 2 Earthworms’ community disturbance, under O. nungara invasion, responsible for metagenomic analysis.
- 2019-2020
- 2019-2021
Funding: Call for Support for the structuring and development of Research, Agence Universitaire de la Francophonie
Title: Fight against food insecurity through the integrated management of pea (Bruchus pisorum) and bean (Acanthoscelides obtectus) insect pests in plantation and storage.
Scientific manager: Pr. Attibayeba, Marien Ngouabi University, Brazzaville
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Publications
- Gergonne D., Fougeyrollas R., Poteaux C., Roisin Y., Armbrecht I., Šobotník J., Valladares Romero C. S., Berthier J. M., Sillam-Dussès D. & Roy V. (2022). The phylogeography of some soil-feeding termites shaped by the Andes, Organisms Diversity & Evolution, 22.
- Dolejšová K., Křivánek J., Štáfková J., Horáček N., Havlíčková J., Roy V., Kalinová B., Roy A., Kyjaková P. & Hanus R. (2022). Identification of a queen primer pheromone in higher termites. Communication Biology, 5, 1165.
- Roy, V., Ventura, M., Fourcade, Y., Justine, J.-L., Gigon, A., & Dupont, L. (2022). Gut content metabarcoding and citizen science reveal the earthworm prey of the exotic terrestrial flatworm, Obama nungara. European Journal of Soil Biology, 113, 103449.
- Andrianjara I., Bordenave-Jacquemin M., Roy V., Cabassa C., Federici P., Carmignac D., Marcangeli Y., Rouhan G., Renard M., Nold F., Lata J.-C., Genet P. & Planchais S. (2021) Urban tree management: diversity of Tilia genus in streets and parks of Paris based on morphological and genetic characteristics, Urban Forestry & Urban Greening, 127382.
- Maggia M.-E., Decaëns T., Lapied E., Dupont L., Roy V., Schimann H., Orivel J., Murienne J., Baraloto C., Cottenie K. & Steinke D. (2021) At each site its diversity: DNA barcoding reveals remarkable earthworm diversity in neotropical rainforests of French Guiana. Applied Soil Ecology, 164, 103932.
- Baudrin G., Roy V., Gigon A. & Dupont L. (2020). Bar-HRM for identification of cryptic earthworm species. Pedobiologia, 80, 150634.
- Célini L., Roy V., Delabie J., Frechault S. & Mora P. (2020). Présence de Solenopsis globularia (Smith, 1858) et Cardiocondyla emeryi Forel, 1881, dans l’île de Saint-Barthélemy aux Antilles Françaises (Formicidae, Myrmicinae). Bulletin de la Société Entomologique de France, 125, 145-152.
- Fougeyrollas R., Dolejšová K., Křivánek J., Sillam-Dussès D., Roisin Y., Hanus R. & Roy V. (2018). Dispersal and mating strategies in two neotropical soil-feeding termites, Embiratermes neotenicus and Silvestritermes minutus (Termitidae, Syntermitinae). Insectes Sociaux, 65, 251-262.
- Sillam-Dussès D. & Roy V. (2018). Species account: Nasutitermes ephratae. In: DE DIJN, B. (ed.) Natural History and Ecology of Suriname, 485pp. LM Publishers, DM Volendam, The Netherlands.
- Taheri S., James S.W., Roy V., Decaëns T., Williams B.W., Anderson F., Rougerie R., Chang C.-H., Brown G. G., Cunha L., Stanton D. W. G., Silva E.D., Chen J.-H., Lemmon A., Bartz M., Baretta D., Barois I., Lapied E., Coulis M. & Dupont L. (2018). Complex taxonomy of the ‘brush tail’ peregrine earthworm Pontoscolex corethrurus. Molecular Phylogenetics and Evolution, 124, 60-70.
- Fougeyrollas R., Křivánek J., Roy V., Dolejšová K., Frechault S., Roisin Y., Hanus R. & Sillam-Dussès D. (2017). Asexual queen succession mediates an accelerated colony life cycle in the termite Silvestritermes minutus. Molecular Ecology, 26, 3295–3308.
- Decaëns T., Porco D., James S.W., Brown G. G., Chassany V., Dubs F., Dupont L., Lapied E., Rougerie R., Rossi J.-P. & Roy V. (2016). DNA barcoding reveals diversity patterns of earthworm communities in remote tropical forests of French Guiana. Soil Biology and Biochemistry, 92, 171-183.
- Dupont L., Porco D., Symondson W.O.C. & Roy V. (2016). Hybridization relics complicate barcode-based identification of species in earthworms. Molecular Ecology Resources, 16, 883-894.
- Kyjaková P., Roy V., Jirošová A., Krasulová J., Dolejšová K., Křivánek J., Hadravová R., Rybáček J., Pohl R., Roisin Y., Sillam-Dussès D. & Hanus R. (2016). Chemical systematics of Neotropical termite genera with symmetrically snapping soldiers (Termitidae: Termitinae). Zoological Journal of the Linnean Society, 180, 66-81.
- Sillam-Dussès D., Hanus R., Poulsen M., Roy V., Favier M. & Vasseur-Cognet M. (2016). The role of the glucose-sensing transcription factor carbohydrate-responsive element-binding protein pathway in termite queen fertility. Open Biology, 6.
- Diouf M., Roy V., Mora P., Frechault S., Lefebvre T., Hervé V., Rouland-Lefèvre C. & Miambi E. (2015). Profiling the succession of bacterial communities throughout the life stages of a higher termite Nasutitermes arborum (Termitidae, Nasutitermitinae) using 16S rRNA gene pyrosequencing. PloS one, 10, e0140014.
- Fougeyrollas R., Dolejšová K., Sillam-Dussès D., Roy V., Hanus R. & Roisin Y. (2015). Asexual queen succession in the higher termite Embiratermes neotenicus. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 282, 20150260.
- Roy V., Girondot M. & Harry M. (2015). The distribution of Wolbachia in Cubitermes (Termitidae, Termitinae) castes and colonies: a modeling approach. PloS one, 10, e0116070.
- Célini L., Roy V., Delabie J., Frechault S., Pando A. & Mora P. (2014). Première mention de Technomyrmex difficilis (Forel, 1892) à Saint-Barthélemy, Petites Antilles (Hymenoptera, Formicidae, Dolichoderinae). Bulletin de la Société Entomologique de France, 119, 293-298.
- Roy V., Constantino R., Chassany V., Giusti-Miller S., Diouf M., Mora P. & Harry M. (2014). Species delimitation and phylogeny in the genus Nasutitermes (Termitidae: Nasutitermitinae) in French Guiana. Molecular Ecology, 23, 902-920.
- Célini L., Roy V., Delabie J., Caquineau S., Questel K. & Mora P. (2013). Premier signalement de Cyphomyrmex minutus Mayr, 1862 à Saint Barthélemy, Petites Antilles (Hymenoptera, Formicidae, Attini). Bulletin de la Société Entomologique de France, 118, 393-398.
- Mora P., Miambi E., Roy V., Giusti S., Blin D., Veyrier T. & Daridon B. (2013). U.S. Patent No. 8,617,283. Use of a solid mineral composition for increasing the fertility of a crop soil or that of a prairie soil. Washington, DC: U.S. Patent and Trademark Office.
- Ruamps L.S., Nunan N., Pouteau V., Leloup J., Raynaud X., Roy V. & Chenu C. (2013). Regulation of soil organic C mineralisation at the pore scale. FEMS Microbiology Ecology, 86, 26-35.
- Célini L., Roy V., Delabie J., Questel K. & Mora P. (2012). Présence et origine d’Acromyrmex octospinosus (Reich, 1793) à Saint-Barthélemy, Petites Antilles (Hymenoptera, Formicidae, Attini). Bulletin de la Société Entomologique de France, 117, 167-172.
- Dupont L., Decaëns T., Lapied E., Chassany V., Marichal R., Dubs F., Maillot M. & Roy V. (2012). Genetic signature of accidental transfer of the peregrine earthworm Pontoscolex corethrurus (Clitellata, Glossoscolecidae) in French Guiana. European Journal of Soil Biology, 53, 70-75.
- Roy V., Dupont L. & Harry M. (2010). Parentage analysis in Gabonese colonies of soil-feeding termites belonging to the Cubitermes sp. affinis subarquatus complex of species (Termitidae: Termitinae). Insect Science, 17, 84-90.
- Dupont L., Roy V., Bakkali A. & Harry M. (2009). Genetic variability of the soil-feeding termite Labiotermes labralis (Termitidae, Nasutitermitinae) in the Amazonian primary forest and remnant patches. Insect Conservation and Diversity, 2, 53-61.
- Harry M., Roy V., Mercier A., Livet A., Garnier E., Bousserrhine N. & Demanche C. (2007). Isolation and characterization of microsatellite markers in Labiotermes labralis (Isoptera, Termitidae, Nasutitermitinae). Molecular Ecology Notes, 7, 121-123.
- Roy V. & Harry M. (2007). Diversity of Wolbachia isolated from the Cubitermes sp. affinis subarquatus complex of species (Termitidae), revealed by multigene phylogenies. Fems Microbiology Letters, 274, 102-111.
- Roy V., Demanche C., Livet A. & Harry M. (2006). Genetic differentiation in the soil-feeding termite Cubitermes sp. affinis subarquatus: occurrence of cryptic species revealed by nuclear and mitochondrial markers. Bmc Evolutionary Biology, 6.
- Roy V., Monti-Dedieu L., Chaminade N., Siljak-Yakovlev S., Aulard S., Lemeunier F. & Montchamp-Moreau C. (2005). Evolution of the chromosomal location of rDNA genes in two Drosophila species subgroups: ananassae and melanogaster. Heredity, 94, 388-395.
- 2022-2025
Financement : ANR, Appel à projets générique – AAPG 2021
Titre : Impact of the PLATyhelminthe Obama nungara invasion on earthWORM communities in France
Responsable scientifique : Lise Dupont, iEES-Paris
Fonction : responsable du Work-Package 2 Earthworms’ community disturbance, under O. nungara invasion, responsable de l’analyse métagénomique.
- 2019-2020
Financement : CNRS PEPS Ecologie des mobilités : espèces invasives, dispersion, migration, recomposition dans des mondes en mutation – ECOMOB 2019
Titre : Les plathelminthes terrestres invasifs : prédation sur les vers de terre et défense chimique
Fonction : coordinatrice du projet, co-responsable de l’action 2 : caractérisation du type de proies et détermination des espèces de vers de terre consommées par O. nungara par métabarcoding du contenu digestif
- 2019-2021
Financement : Appel d’offre Soutien à la structuration et au développement de la recherche, Agence Universitaire de la Francophonie
Titre : Lutte contre l’insécurité alimentaire par la gestion intégrée des insectes ravageurs de pois (Bruchus pisorum) et de haricots (Acanthoscelides obtectus) en plantation et en stockage.
Responsable scientifique : Pr. Attibayeba, Université Marien Ngouabi, Brazzaville
Fonction : Responsable de la caractérisation moléculaire des Bruchus et Acanthoscelides (Lot 1 : Structuration des biotypes de B. pisorum et Acanthoscelides obtectus dans l’espace Congo-Gabon-Cameroun et détermination des cycles phénologiques des variétés de haricots et de pois dans les zones de production).
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Enseignement
Activités et responsabilités
Enseignante à l’Université Paris-Est Créteil depuis 2007, j’enseigne la Biologie animale, l’Evolution et l’Ecologie dans les formations suivantes :
– Licence 2 et 3 Sciences de la Vie et de la Terre (UPEC)
– Master 1 Métiers de l’Enseignement, de l’Education et de la Formation 2nd degré parcours Sciences de la Vie et de la Terre (UPEC/UPC)
– Master 1 Sciences et technologie de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement parcours Ingénierie biologique pour l’environnement (UPEC)
– Master Science politique parcours Transformations socio-environnementales (UPEC)
– Option d’ouverture Biodiversité et Développement Durable (UPEC)
J’ai la responsabilité de plusieurs Unités d’Enseignement en Licence SVT :
-Biologie des organismes animaux 2 (depuis 2014)
-Diversité et évolution des Métazoaires (depuis 2020)
-Stage professionnalisant en sciences de l’environnement (depuis 2020)
-Stage semestre 6 du parcours Biologie-Environnement (depuis 2020).
Je suis responsable de la coordination du parcours Biologie Environnement de la Licence SVT UPEC (50 étudiants en L2, 45 en L3).
https://www.u-pec.fr/fr/formation/niveau-l/licence-sciences-de-la-vie-et-de-la-terre-parcours-biologie-environnement
Je participe également au PSF South AGREES Lao (coordinateur scientifique : C. Hartmann, IRD/iEES-Paris) pour le montage du premier Master en Sciences de l’environnement et du premier programme de doctorat (Agricultural Sciences and Natural Resources Management) au Laos.
https://en.ird.fr/psf-south-agrees-lao-2019-2021
Associate professor at Paris-Est Créteil University since 2007, I teach Animal Biology, Evolution and Ecology in the following courses:
– Licence 2 et 3 Sciences de la Vie et de la Terre (Bachelor’s degree)
– Master 1 Métiers de l’Enseignement, de l’Education et de la Formation 2nd degré parcours Sciences de la Vie et de la Terre (Master’s degree)
– Master 1 Sciences et technologie de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement parcours Ingénierie biologique pour l’environnement
– Master Science politique parcours Transformations socio-environnementales
– Biodiversity and Sustainable Development opening option
I am responsible for several Teaching Units in Licence SVT:
– Biology of animal organisms 2 (since 2014)
– Diversity and evolution of Metazoa (since 2020)
– Professional internship in environmental sciences (since 2020)
– Internship semester 6 of the Biology and Environment speciality (since 2020).
I am responsible for coordinating the Biology and Environment speciality of the Licence SVT (50 students in L2, 45 in L3).
https://www.u-pec.fr/fr/formation/nivel-l/licence-sciences-de-la-vie-et-de-la-terre-parcours-biologie-environnement
I also participate in the PSF South AGREES Lao (scientific coordinator: C. Hartmann, IRD/iEES-Paris) for the setting up of the first Master in Environmental Sciences and the first doctoral program (Agricultural Sciences and Natural Resources Management) in Laos.
https://en.ird.fr/psf-south-agrees-lao-2019-2021
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Encadrement / Supervision
- 2022- : Shanèze Noël (50% L. Dupont)
- 2019- : Damien Gergonne (50% D. Sillam-Dussès et Chantal Poteaux)
- 2013-2016 : Romain Fougeyrollas (50% D. Sillam-Dussès)
- 2021-2022 : Shanèze Noël (50% L. Dupont)
- 2018-2019 : Tatiana Grouin
- 2014-2015 : Akil Mougammadally
- 2012-2013 : Romain Fougeyrollas (50% D. Sillam-Dussès)
- 2009-2010 : Rabia Rais (50% N. Bousserrhine)
- 2009-2010 : Joelle Comair (50% N. Bousserrhine)
- 2009-2010 : Zakia Aid
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