Virginie Roy

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Université Paris-Est Créteil
Institut d’Ecologie et des Sciences de l’Environnement de Paris
Faculté des Sciences et Technologie
Bâtiment P4, bureau 420
61, avenue du Général de Gaulle
94010 Créteil Cedex

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Call: +33 1 45 17 16 14

Email: roy@u-pec.fr

Research Interests

  • Biologie moléculaire
  • Ecologie évolutive
  • Génétique des populations
  • Macrofaune du sol
  • Phylogénie

ROY Virginie

 

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J’effectue ma recherche dans le Département Diversité des Communautés et Fonctionnement des Écosystèmes (DCFE), dans l’équipe Biogéographie et Diversité des Interactions du Sol (BioDIS). Mes thématiques de recherche sont la délimitation et l’identification des espèces, les systèmes de reproduction et la dispersion de la macrofaune du sol, en particulier dans les écosystèmes tropicaux. Mes modèles sont les termites humivores, les vers de terre, les fourmis, et plus récemment les plathelminthes terrestres invasifs et les bruches. J’utilise des outils moléculaires (barcoding et métabarcoding ADN, Bar-HRM, séquençage multigénique, génotypage microsatellites) et mes approches sont la phylogéographie, la génétique/génomique des populations et la taxonomie intégrative.

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Projets

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  • 2022-2025

Financement : ANR, Appel à projets générique – AAPG 2021

Titre : Impact of the PLATyhelminthe Obama nungara invasion on earthWORM communities in France

Responsable scientifique : Lise Dupont, iEES-Paris

Fonction : responsable du Work-Package 2 Earthworms’ community disturbance, under O. nungara invasion, responsable de l’analyse métagénomique.

  • 2019-2020

Financement : CNRS PEPS Ecologie des mobilités : espèces invasives, dispersion, migration, recomposition dans des mondes en mutation – ECOMOB 2019

Titre : Les plathelminthes terrestres invasifs : prédation sur les vers de terre et défense chimique

Fonction : coordinatrice du projet, co-responsable de l’action 2 : caractérisation du type de proies et détermination des espèces de vers de terre consommées par O. nungara par métabarcoding du contenu digestif

  • 2019-2021

Financement : Appel d’offre Soutien à la structuration et au développement de la recherche, Agence Universitaire de la Francophonie

Titre : Lutte contre l’insécurité alimentaire par la gestion intégrée des insectes ravageurs de pois (Bruchus pisorum) et de haricots (Acanthoscelides obtectus) en plantation et en stockage.

Responsable scientifique : Pr. Attibayeba, Université Marien Ngouabi, Brazzaville

Fonction : Responsable de la caractérisation moléculaire des Bruchus et Acanthoscelides (Lot 1 : Structuration des biotypes de B. pisorum et Acanthoscelides obtectus dans l’espace Congo-Gabon-Cameroun et détermination des cycles phénologiques des variétés de haricots et de pois dans les zones de production).

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Publications

À iEES Paris
Hors iEES Paris
À iEES Paris

  1. Andrianjara I., Bordenave-Jacquemin M., Roy V., Cabassa C., Federici P., Carmignac D., Marcangeli Y., Rouhan G., Renard M., Nold F., Lata J.-C., Genet P. & Planchais S. (2021) Urban tree management: diversity of Tilia genus in streets and parks of Paris based on morphological and genetic characteristics, Urban Forestry & Urban Greening, 127382.
  2. Maggia M.-E., Decaëns T., Lapied E., Dupont L., Roy V., Schimann H., Orivel J., Murienne J., Baraloto C., Cottenie K. & Steinke D. (2021) At each site its diversity: DNA barcoding reveals remarkable earthworm diversity in neotropical rainforests of French Guiana. Applied Soil Ecology, 164, 103932.
  3. Baudrin G., Roy V., Gigon A. & Dupont L. (2020). Bar-HRM for identification of cryptic earthworm species. Pedobiologia, 80, 150634.
  4. Célini L., Roy V., Delabie J., Frechault S. & Mora P. (2020). Présence de Solenopsis globularia (Smith, 1858) et Cardiocondyla emeryi Forel, 1881, dans l’île de Saint-Barthélemy aux Antilles Françaises (Formicidae, Myrmicinae). Bulletin de la Société Entomologique de France, 125, 145-152.
  5. Fougeyrollas R., Dolejšová K., Křivánek J., Sillam-Dussès D., Roisin Y., Hanus R. & Roy V. (2018). Dispersal and mating strategies in two neotropical soil-feeding termites, Embiratermes neotenicus and Silvestritermes minutus (Termitidae, Syntermitinae). Insectes Sociaux, 65, 251-262.
  6. Sillam-Dussès D. & Roy V. (2018). Species account: Nasutitermes ephratae. In: DE DIJN, B. (ed.) Natural History and Ecology of Suriname, 485pp. LM Publishers, DM Volendam, The Netherlands.
  7. Taheri S., James S.W., Roy V., Decaëns T., Williams B.W., Anderson F., Rougerie R., Chang C.-H., Brown G. G., Cunha L., Stanton D. W. G., Silva E.D., Chen J.-H., Lemmon A., Bartz M., Baretta D., Barois I., Lapied E., Coulis M. & Dupont L. (2018). Complex taxonomy of the ‘brush tail’ peregrine earthworm Pontoscolex corethrurus. Molecular Phylogenetics and Evolution, 124, 60-70.
  8. Fougeyrollas R., Křivánek J., Roy V., Dolejšová K., Frechault S., Roisin Y., Hanus R. & Sillam-Dussès D. (2017). Asexual queen succession mediates an accelerated colony life cycle in the termite Silvestritermes minutus. Molecular Ecology, 26, 3295–3308.
  9. Decaëns T., Porco D., James S.W., Brown G. G., Chassany V., Dubs F., Dupont L., Lapied E., Rougerie R., Rossi J.-P. & Roy V. (2016). DNA barcoding reveals diversity patterns of earthworm communities in remote tropical forests of French Guiana. Soil Biology and Biochemistry, 92, 171-183.
  10. Dupont L., Porco D., Symondson W.O.C. & Roy V. (2016). Hybridization relics complicate barcode-based identification of species in earthworms. Molecular Ecology Resources, 16, 883-894.
  11. Kyjaková P., Roy V., Jirošová A., Krasulová J., Dolejšová K., Křivánek J., Hadravová R., Rybáček J., Pohl R., Roisin Y., Sillam-Dussès D. & Hanus R. (2016). Chemical systematics of Neotropical termite genera with symmetrically snapping soldiers (Termitidae: Termitinae). Zoological Journal of the Linnean Society, 180, 66-81.
  12. Sillam-Dussès D., Hanus R., Poulsen M., Roy V., Favier M. & Vasseur-Cognet M. (2016). The role of the glucose-sensing transcription factor carbohydrate-responsive element-binding protein pathway in termite queen fertility. Open Biology, 6.
  13. Diouf M., Roy V., Mora P., Frechault S., Lefebvre T., Hervé V., Rouland-Lefèvre C. & Miambi E. (2015). Profiling the succession of bacterial communities throughout the life stages of a higher termite Nasutitermes arborum (Termitidae, Nasutitermitinae) using 16S rRNA gene pyrosequencing. PloS one, 10, e0140014.
  14. Fougeyrollas R., Dolejšová K., Sillam-Dussès D., Roy V., Hanus R. & Roisin Y. (2015). Asexual queen succession in the higher termite Embiratermes neotenicus. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 282, 20150260.
  15. Roy V., Girondot M. & Harry M. (2015). The distribution of Wolbachia in Cubitermes (Termitidae, Termitinae) castes and colonies: a modeling approach. PloS one, 10, e0116070.
  16. Célini L., Roy V., Delabie J., Frechault S., Pando A. & Mora P. (2014). Première mention de Technomyrmex difficilis (Forel, 1892) à Saint-Barthélemy, Petites Antilles (Hymenoptera, Formicidae, Dolichoderinae). Bulletin de la Société Entomologique de France, 119, 293-298.
  17. Roy V., Constantino R., Chassany V., Giusti-Miller S., Diouf M., Mora P. & Harry M. (2014). Species delimitation and phylogeny in the genus Nasutitermes (Termitidae: Nasutitermitinae) in French Guiana. Molecular Ecology, 23, 902-920.
  18. Célini L., Roy V., Delabie J., Caquineau S., Questel K. & Mora P. (2013). Premier signalement de Cyphomyrmex minutus Mayr, 1862 à Saint Barthélemy, Petites Antilles (Hymenoptera, Formicidae, Attini). Bulletin de la Société Entomologique de France, 118, 393-398.
  19. Mora P., Miambi E., Roy V., Giusti S., Blin D., Veyrier T. & Daridon B. (2013). U.S. Patent No. 8,617,283. Use of a solid mineral composition for increasing the fertility of a crop soil or that of a prairie soil. Washington, DC: U.S. Patent and Trademark Office.
  20. Ruamps L.S., Nunan N., Pouteau V., Leloup J., Raynaud X., Roy V. & Chenu C. (2013). Regulation of soil organic C mineralisation at the pore scale. FEMS Microbiology Ecology, 86, 26-35.
  21. Célini L., Roy V., Delabie J., Questel K. & Mora P. (2012). Présence et origine d’Acromyrmex octospinosus (Reich, 1793) à Saint-Barthélemy, Petites Antilles (Hymenoptera, Formicidae, Attini). Bulletin de la Société Entomologique de France, 117, 167-172.
  22. Dupont L., Decaëns T., Lapied E., Chassany V., Marichal R., Dubs F., Maillot M. & Roy V. (2012). Genetic signature of accidental transfer of the peregrine earthworm Pontoscolex corethrurus (Clitellata, Glossoscolecidae) in French Guiana. European Journal of Soil Biology, 53, 70-75.
  23. Roy V., Dupont L. & Harry M. (2010). Parentage analysis in Gabonese colonies of soil-feeding termites belonging to the Cubitermes sp. affinis subarquatus complex of species (Termitidae: Termitinae). Insect Science, 17, 84-90.
  24. Dupont L., Roy V., Bakkali A. & Harry M. (2009). Genetic variability of the soil-feeding termite Labiotermes labralis (Termitidae, Nasutitermitinae) in the Amazonian primary forest and remnant patches. Insect Conservation and Diversity, 2, 53-61.
  25. Harry M., Roy V., Mercier A., Livet A., Garnier E., Bousserrhine N. & Demanche C. (2007). Isolation and characterization of microsatellite markers in Labiotermes labralis (Isoptera, Termitidae, Nasutitermitinae). Molecular Ecology Notes, 7, 121-123.
  26. Roy V. & Harry M. (2007). Diversity of Wolbachia isolated from the Cubitermes sp. affinis subarquatus complex of species (Termitidae), revealed by multigene phylogenies. Fems Microbiology Letters, 274, 102-111.
  27. Roy V., Demanche C., Livet A. & Harry M. (2006). Genetic differentiation in the soil-feeding termite Cubitermes sp. affinis subarquatus: occurrence of cryptic species revealed by nuclear and mitochondrial markers. Bmc Evolutionary Biology, 6

Hors iEES Paris

  1. Roy V., Monti-Dedieu L., Chaminade N., Siljak-Yakovlev S., Aulard S., Lemeunier F. & Montchamp-Moreau C. (2005). Evolution of the chromosomal location of rDNA genes in two Drosophila species subgroups: ananassae and melanogaster. Heredity, 94, 388-395.

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Enseignement

Activités et responsabilités

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Enseignante à l’Université Paris-Est Créteil depuis 2007, j’enseigne la Biologie animale, l’Evolution et l’Ecologie dans les formations suivantes :
–  Licence 2 et 3 Sciences de la Vie et de la Terre (UPEC)
– Master 1 Métiers de l’Enseignement, de l’Education et de la Formation 2nd degré parcours Sciences de la Vie et de la Terre (UPEC/UPC)
– Master 1 Sciences et technologie de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement parcours Ingénierie biologique pour l’environnement (UPEC)
– Master Science politique parcours Transformations socio-environnementales (UPEC)
– Option d’ouverture Biodiversité et Développement Durable (UPEC)

J’ai la responsabilité de plusieurs Unités d’Enseignement en Licence SVT :
-Biologie des organismes animaux 2 (depuis 2014)
-Diversité et évolution des Métazoaires (depuis 2020)
-Stage professionnalisant en sciences de l’environnement (depuis 2020)
-Stage semestre 6 du parcours Biologie-Environnement (depuis 2020).

Je suis responsable de la coordination du parcours Biologie Environnement de la Licence SVT UPEC (50 étudiants en L2, 45 en L3).
https://www.u-pec.fr/fr/formation/niveau-l/licence-sciences-de-la-vie-et-de-la-terre-parcours-biologie-environnement

Je participe également au PSF South AGREES Lao (coordinateur scientifique : C. Hartmann, IRD/iEES-Paris) pour le montage du premier Master en Sciences de l’environnement et du premier programme de doctorat (Agricultural Sciences and Natural Resources Management) au Laos.
https://en.ird.fr/psf-south-agrees-lao-2019-2021

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Encadrement / Supervision

PhDs
Masters
PhDs

  • 2022- : Shanèze Noël (50% L. Dupont)
  • 2019- : Damien Gergonne (50% D. Sillam-Dussès et Chantal Poteaux)
  • 2013-2016 : Romain Fougeyrollas (50% D. Sillam-Dussès)

Masters

Masters 2

  • 2021-2022 : Shanèze Noël (50% L. Dupont)
  • 2018-2019 : Tatiana Grouin
  • 2014-2015 : Akil Mougammadally
  • 2012-2013 : Romain Fougeyrollas (50% D. Sillam-Dussès)
  • 2009-2010 : Rabia Rais (50% N. Bousserrhine)
  • 2009-2010 : Joelle Comair (50% N. Bousserrhine)
  • 2009-2010 : Zakia Aid

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Formation

  1. 2022

    Diplôme Universitaire Sciences cognitives pour l'éducation et la formation

    Université Paris-Est Créteil
  2. 2019

    Habilitation à Diriger des Recherches

    Université Paris-Est Créteil
  3. 2005

    Doctorat en Génétique évolutive

    Université Paris-Est Créteil
  4. 2002

    DEA Biodiversité : Génétique, Histoire et Mécanismes de l’Evolution

    Université Paris-Saclay
  5. 2001

    Maîtrise de Biologie des Populations et Ecosystèmes

    Université Paris-Saclay
  6. 2000

    Licence de Biologie des Organismes

    Université Paris-Saclay
  7. 1999

    DEUG Sciences de la Vie

    Université Paris-Saclay

Parcours professionnel

  1. 2007-aujourd'hui
    Maître de Conférences
    Université Paris-Est Créteil
  2. 2006-2007
    ATER Biologie animale
    Université Paris-Est Créteil
  3. 2005-2006
    ATER Génétique des populations
    Université Paris-Est Créteil