GENET Patricia
Maitre de Conférences
Université Paris Cité – Faculté des Sciences
Département Diversité des Communautés et Fonctionnement des Écosystèmes “DCFE“
Équipe Écologie et Évolution des Réseaux d’Interactions “EERI”
Au sein de l’équipe EERI, je m’intéresse particulièrement aux sols, à leur fonctionnement et leur biodiversité. En particulier, je cherche à mieux comprendre l’influence des microorganismes du sol sur la composition des communautés de plantes et la coexistence des espèces ainsi que sur le fonctionnement physiologique des plantes. Depuis quelques années, ma recherche s’oriente vers les sols urbains et l’impact des contraintes urbaines (pollution par les éléments traces, manque d’eau) sur les microorganismes du sol et le fonctionnement de la flore urbaine.
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Ma recherche
– Symbiose mycorhizienne et coexistence des espèces végétales
La symbiose mycorhizienne (du grec rhiza = racine et myco = champignon) est une association à bénéfices et coûts réciproques très largement répandue dans la nature puisque plus de 80% des plantes terrestres actuelles sont mycorhizées. Ces symbioses favorisent la nutrition minérale et hydrique des plantes, leur protection, et jouent donc un rôle majeur dans la survie et la coexistence des espèces végétales et leur adaptation à leur environnement de vie. Nous avons ainsi montré, en culture in vitro ainsi que dans des conditions semi-contrôlées, des effets positifs d’une communauté de plantes diversifiée, plutôt que monospécifique, sur le développement des champignons et inversement. Les effets bénéfiques des champignons sont plus importants chez les plantes fortement dépendantes de la mycorhization pour leur développement et cet effet est présent dès l’établissement de la symbiose chez les plantules et perdure jusqu’à floraison.
– Microorganismes du sol et croissance des plantes en milieu urbain
L’explosion démographique des dernières décennies a engendré un processus d’urbanisation galopante. Il en résulte que près de 50% de la population humaine mondiale vit en ville. Depuis une quarantaine d’années, les conséquences de l’urbanisation remettent en question la durabilité des villes et la survie de nombreuses espèces. Parmi celles-ci, la végétation sous toutes ses formes est importante car elle participe par exemple à l’embellissement de notre cadre de vie, améliore notre qualité de vie (réduction des îlots de chaleur, en particulier par les arbres, absorption des eaux de pluie, dépollution de l’air, ….) et constitue une source de nourriture et un habitat pour quantité d’autres espèces.
Les interactions privilégiées que les plantes entretiennent avec les microorganismes du sol font qu’il est difficile de séparer les uns des autres quand on souhaite mieux comprendre comment fonctionnent les communautés végétales en milieu urbain. Mes recherches se focalisent sur le rôle des microorganismes du sol, en particulier les champignons mycorhiziens, dans les réponses des plantes, notamment des arbres, à différentes contraintes urbaines (contamination des sols par les éléments traces (ET), manque d’eau). Ces contraintes résultent en partie des infrastructures qui sont construites. Ainsi, dans les rues, et même certains parcs urbains, les sols sont souvent recouverts d’un revêtement plus ou moins poreux qui va modifier les écoulements de l’eau sur et dans les sols et ainsi potentiellement influer sur la disponibilité en eau et la biodisponibilité des contaminants du sol pour les plantes. Quelle est la dynamique des communautés microbiennes dans de telles conditions ? Et quelles sont les conséquences sur la croissance et le développement des plantes ? Quels niveaux de contamination en ET peut-on retrouver dans la végétation ? Voici quelques unes des questions que je me pose. Outre l’intérêt scientifique, ces travaux visent également à être utiles aux gestionnaires d’espaces verts dans le cadre par exemple de la valorisation des produits d’élagage dans la production de compost ou encore le développement d’une agriculture urbaine durable.
Mots clé : écologie des sols, symbioses mycorhiziennes, écologie végétale, milieu urbain
– Collaboration avec des physiciens sur la croissance racinaire et la structuration du sol
Expertise scientifique
Je suis régulièrement sollicitée par différentes revues scientifiques à comité de lecture pour la relecture d’articles :
- African J of Bacteriology Resaerch
- Ecologia Mediterranea
- Pedosphere
- Symbiosis
J’ai participé à plusieurs jury de thèse en tant qu’encadrante ou examinatrice, ainsi qu’à différents comités de spécialistes pour le recrutement d’enseignants-chercheurs de rang B et PrAg. Chaque année, je suis également rapporteur de stages de M2 (Master BEE – SU, Master RE – Université Paris Cité).
Publications
Articles de journaux scientifiques
Andrianjara I., Bordenave-Jacquemin M., Roy V., Cabassa C., Federici P., Carmignac D., Marcangeli Y., Rouhan G., Renard M., Nold F., Lata J.-C., Genet P., Planchais S. (2021) Urban tree management: Diversity of Tilia genus in streets and parks of Paris based on morphological and genetic characteristics. Urban Forestry & Urban Greening 66: 127382
Derelle D., Declerck S., Genet P., Dajoz I. & van Aarle I. M. (2012) Association of highly and weakly mycorrhizal seedlings can promote the extra- and intraradical development of a common mycorrhizal network. FEMS Microbiol Ecol 79: 251–259
Derelle D., Courty P.-E. Dajoz I., Declerck S., van Aarle I. M., Carmignac D., and Genet P. (2015) Plant identity and density can influence arbuscular mycorrhizal fungi colonization, plant growth, and reproduction investment in coculture. Botany 93: 405–412
Dexheimer J., Gérard J. & Genet P. (1994) Etude des modalités de la mycorhization de pivots d’Eucalyptus globulus développés en clinostat. Acta Botanica Gallica, 141(4): 511-516
Genet P. · Prevost A. & Pargney J.-C. (2000) Seasonal variations of symbiotic ultrastructure and relationships of two natural ectomycorrhizae of beech (Fagus sylvatica/Lactarius blennius var. viridis and Fagus sylvatica/Lactarius subdulcis). Trees 14: 465–474
Kolb E., Hartmann C. & Genet P. (2012) Radial force development during root growth measured by photoelasticity. Plant Soil 360: 19–35
Shahzad T., Chenu C., Genet P., Barot S., Perveen N.,Mougin C., Fontaine S. (2015) Contribution of exudates, arbuscular mycorrhizal fungi and litter depositions to the rhizosphere priming effect induced by grassland species. Soil Biology and Biochesmistry 80: 146-155
Watteau F., Villemin G., Ghanbaja J., Genet P., Pargney J.-C. (2002) In situ ageing of fine beech roots (Fagus sylvatica) assessed by transmission electron microscopy and electron energy loss spectroscopy: description of microsites and evolution of polyphenolic substances. Biology of the Cell 94: 55–63
Autres types de publications
2011. Johann Müller, Véronique Nicolas, Aleksandar Rankovic, Patricia Genet, Gérard Lacroix, Florence Hulot. L’eau : ingénierie d’un continuum. LES Rencontres DE L’ONEMA. http://www.onema.fr/les-rencontres-de-l-one
2021. Trace element contamination of urban Tilia spp trees in streets and parks in Paris. I. Andrianjara, P. Genet, S. Planchais, C. Cabassa, M. Renard, F. Nold, J6C. Lata. Journées scientifiques de iEES Paris (poster).
2021. Indicators of environmental stresses in Tilia genus trees. I. Andrianjara, P. Genet, M. Renard, Y. Marcangeli, D. Carmignac, A. Hansart, F. Nold, J6C. Lata, C. Cabassa, S. Planchais. Journées scientifiques de iEES Paris (poster).
2019. Trace element contamination and proline content iin urban trees of Paris area (France). Iry Andrianjara (oratrice), Patricia Genet, Séverine Planchais, Cécile Cabassa, François Nold, Jean-Christophe Lata. British Ecological Society Annual Meeting in Belfast, 10-13 décembre 2019.
2019. Structures des communautés microbiennes des sols urbains au pied de tilleuls dans les rues et parcs parisiens. Patricia Genet (oratrice). Journée scientifique co organisée iEES Paris et la Ville de Paris. 3 décembre 2019 à Paris.
2019. How can ecology science contribute to green cities. Iry Andrianjara (oratrice), Patricia Genet, Séverine Planchais, Cécile Cabassa, François Nold, Jean-Christophe Lata. The Nature of Cities (TNOC) Summit in Paris, 4-7 Juin 2019.
2016. Impact of mycorrhization on plant response to soil pollution by heavy metals. N. Ruhomauly, L. Pinek, M. Castrex-Rouelle, P. Genet. Colloque Société française d’écologie et évolution, Marseille 2016 (poster).
2016. Root growth inside a pore. E. Kolb (oratrice), P. Kurowski, T. Deleplanque, P. Genet, L. Hattali, C. Hartmann.. Présentation invitée à ECMTB (Nottingham)-11-15 July 2016.
2015. Impact of mechanical stresses on the plant root morphogenesis. E. Kolb (oratrice), P. Kurowski, P. Genet, C. Hartmann, L. Hattali. 9th European Solid Mechanics Conference (ESMC 2015) July 6 – 10, 2015, Leganés-Madrid, Spain.
2014. Radial force development during root growth measured by photoelasticity. E. Kolb (oratrice), P. Kurowski, in collaboration with C. Hartmann and P. Genet. Présentation GDR CellTiss
2014. Caractérisation mécanique d’une racine en cours de séchage. E. Kolb (oratrice), P. Kurowski, P. Genet, L. Hattali, C. Hartmann, R. Peralta y Fabi, C. Vautrin, L. Bibal, M. Chassagne. Présentation GDR MEPHYS, 13 Nov 2014.
2011. Interspecific plant interaction may influence positively AMF development and colonization. D. Derelle, P-E. Courty, D. Carmignac, S. Declerck, I. Dajoz, I-M van Aarle, P. Genet. Rhizosphere, 3 International Conference, Perth, Western Australia, 25-30 September 2011 (poster).
2010. La coexistence entre espèces végétales influe sur la colonisation racinaire d’une espèce cible par un champignon mycorhizien. D. Derelle, S. Declerck, P. Genet, I. Dajoz, I. M. van Aarle. Colloque national d’écologie Montpellier. Septembre 2010.
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Enseignement
Activités et responsabilités
Activités d’enseignement
Mes activités d’enseignement se déroulent essentiellement à l’UFR Sciences du Vivant de la Faculté des Sciences de Université Paris Cité, sur le campus des Grands Moulins (Paris 13).
Disciplines enseignées : biologie végétale, écologie des plantes, écologie des sols, biologie et écologie des Fungi, Formation au diagnostic écologique.
Nature des enseignements : cours magistraux, travaux pratiques et travaux dirigés, stages et sorties de terrain, soutenances de stage de licence et de master.
Cursus : du L1 au M2, Licence Sciences de la vie (SV), Licence Sciences de la vie et de la terre (SVT), Licence MIASH parcours Professorat des écoles, Master Risques & Environnement (RE).
Responsabilités pédagogiques
- co responsable de la licence SVT jusqu’en 2019
- membre des commissions d’admission de la licence SVT (L1, L2, L3) jusqu’en 2019, du master RE (M1, M2)
- membre des jurys de diplôme (Licences SV et SVT jusqu’en 2019 ; Master RE)
- membre élu du conseil d’enseignement de l’UFR Sciences du vivant jusqu’en 2019
- membre des comités de pilotage et des conseils de perfectionnement des licences SV et SVT jusqu’en 2019 ; du master RE
- coresponsable d’UE de licence et de master
- information (journées portes ouvertes, printemps des masters,…) et suivi des étudiants de licence et de master
- enseignante référente de stagiaires de licences et de master
- membre de commissions ad’hoc d’avancement des enseignants-chercheurs de rang B
- membre de comité de spécialistes pour le recrutement d’enseignants chercheurs de rang B, de PrAg.
Actuellement, je suis co responsable pédagogique du parcours de Master 2 Ecosystèmes & Biodiversité – Expertise écologique au sein de la mention de master Risques & Environnement de l’Université Paris Cité.
Expertise
Encadrement
Depuis mon recrutement, j'ai encadré plusieurs étudiants de licence, master et de doctorat. Depuis 2015 :
- 2009-2012 : Thèse d’université en biologie-écologie de Damien Derelle (co encadrement avec l’Université catholique de Louvain, Belgique).
Effets des associations de plantes sur la symbiose mycorhizienne et réponse spécifique des plantes à la mycorhization.
- 2018-2021 : Thèse d’université en écologie de Iry Andrianjara (contrat doctoral CIFRE avec la Ville de Paris)
Evaluation croisée de la contamination en éléments traces et d’indicateurs de stress en milieu urbain chez les Tilia spp. à Paris (France)
Depuis 2015 :
- 2015 : stage de M1 EBE-UPMC. Effets de la mycorhization sur Echium plantagineum ayant subi une pollution aux métaux lourds (Zinc et Cadmium)
- 2015 : M2 Géochimie environnementale-UPMC. Transfert de métaux lourds dans le continuum sol – champignons mycorhiziens – plantes herbacées en milieu urbain simulé
- 2018 : M2 Microbiologie, Environnement, Santé -MNHN. Structures des communautés microbiennes des sols urbains au pied de tilleuls (Tilia spp.) d’alignement dans les parcs et rues parisiens
- 2020 : M1 BEE-SU. Lien entre croissance des arbres, marqueurs de stress et contraintes environnementales en milieu urbain.