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Écologie des bactéries hétérotrophes en milieu tropicale

Le thème central de mes recherches est l’étude de l’écologie des bactéries hétérotrophes en milieu tropicale. J’examine également comment les impacts anthropiques, tels que l’augmentation des apports inorganiques et organiques ou les changements des usages des terres modifient la diversité génétique et fonctionnels dès communautés microbiennes afin de comprendre les impacts des activités humaines dans les systèmes aquatiques. J’utilise un large éventail de techniques (cultures, mésocosmes, in situ) et dans une diversité de situations (bateau, terrain, laboratoire) et de pays en Asie-Pacifique et Afrique de l’Ouest.

Carbone organique dissous (COD) et coloré (CODC)

Je m’intéresse également au carbone organique dissous (COD) et à sa fraction optiquement active, le CODC), et aux processus qui affectent leur présence dans les écosystèmes aquatiques. Par exemple, comment le changement climatique pourrait-il avoir un impact sur les concentrations de CODC dans les eaux douces ? Comment le changement d’utilisation des terres a-t-il un impact sur le CODC dans les rivières et ruisseaux tropicaux ? Quels pourraient être les impactent sur les processus microbiens et le fonctionnement des écosystèmes ?

Un regard croisé entre l’écologie microbienne et la santé des écosystèmes et des personnes

Un autre aspect plus récent de mon travail concerne l’étude des bactéries indicatrices fécales dans les écosystèmes aquatiques. Je commence également à examiner d’autres pathogènes bactériens dans le but de comprendre comment la dégradation de l’environnement altère l’écologie de ces microbes. En croisant notre compréhension de l’écologie microbienne avec  la géographie de la santé humaine, nous pouvons progresser vers une meilleure compréhension des risques et des vulnérabilités auxquels sont confrontées les populations humaines exploitant les ressources hydriques.

Renforcement des compétences transversales aux métiers de chercheur.es et ingénieur.e.s

Je donne aussi régulièrement des cours sur la rédaction des articles scientifiques. Ces cours visent spécifiquement à renforcer les capacités de recherche des étudiants et des jeunes chercheurs des pays en développement.

Mots-Clefs :Carbone organique dissous, usages, écologie microbienne, EcoHealth/OneHealth, renforcement des compétences transversales

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Microbial ecology in tropical ecosystems

I study the ecology of the heterotrophic bacteria in tropical environments. I also look at how anthropogenic impacts, such as increased inputs of inorganic and organic pollutants or changes in land use modify genetic and functional diversity in microbial communities in order to understand the impacts of human activities in aquatic systems. In my work I have applied a wide range of techniques (cultures, mesocosms, in situ) to a variety of situations (boat, field, laboratory) and in a diversity countries in Asia and the Pacific and in West Africa.

DOC and CDOM

I am also interested in dissolved organic carbon and it’s optically active fraction CDOM and the processes that affect their presence in aquatic ecosystems. For example, how might climate change impact CDOM concentrations in freshwaters? How does land use change impact CDOM in tropical rivers and streams? What might be the knock-on effects on microbial processes and ecosystem functionning?

A crossroads between microbial ecology and human and ecosystem health

Another more recent aspect of my work concerns the study of Faecal Indicator Bacteria in aquatic ecosystems. I am also starting to look at other bacterial pathogens with the goal of understanding how environmental degradation alters the ecology of these microbes. By crossing our understanding of microbial ecology with insights from human health geography, we can move towards a better understanding of the risks and vulnerabilities that human populations face using untreated surface water resources.

Reinforcing cross-cutting skills in research and engineering

I also regularly give courses on writing scientific articles. These courses specifically aim to build capacity of students and young researchers from developing countries.

Keywords : Dissolved organic carbon (DOC), chromophoric dissolved organic matter (CDOM), land and water use, microbial ecology, EcoHealth/OneHealth, Cross-cutting skills